通常为了节省成本，多数商家会使用地下水或是井水作为馒头加工的原水，井水有腥气不是大问题，因为这些挥发性的成分做出馒头大多数已经挥发走了。真正的问题是地下水的硬度大，加工出的馒头容易结一些硬的疙瘩（不溶于水的钙盐和镁盐）。

尽管目前我国自来水的出厂标准也是可直接饮用的，但是远距离输水，要考虑二次污染问题。所以为了增加馒头的外观以及口感，通常会使用反渗透设备进行处理，出水可达到纯净水的标准。具体的配置还是要根据原水的情况进行判别。